上阿图什镇卫生院始建于1956年，从当年的小卫生室逐步发展成现在的规模，尤其是近年来在州、市两级领导的亲切关怀及内地兄弟省市的无私援助下，镇医院得到了突飞猛进的发展，无论从医院规模、硬件设施、还是从医护人员队伍素质来看，医疗条件都与过去不可同日而语。特别是2014年根据乡镇卫生院标准化建设要求，现有占地面积10530㎡，建筑面积6800㎡，（其中公共卫生楼于2007年建成，建筑面积1200㎡，门诊楼于2009年建成，建筑面积1100㎡，住院楼于2015年建成，建筑面积2200㎡，职工周转房64套面积2300㎡），下设喀依拉克分院一所。现有职工97名，其中医生47名（副主任医师3名，主治医师8名，住院医师37名），护士31名，卫生院内设有门诊、住院、妇幼保健、内儿科、外科、妇产科、康复、全科医疗、辅助检查等科室；医院开设床位100张，其中中心院70张，喀依拉克分院30张。全镇共有17个村卫生室，共有60名乡村医生。现有CR和DR型X光机2台，多普勒彩色B超2台，全自动生化分析仪2台，全自动血细胞分析仪2台，尿十项分析仪4台，心电图5台，监护仪1台，洗胃机1台，除颤仪1台，呼吸机1台等医疗设备。救护车1辆。为辖区54043人口提供预防、保健、康复、健康教育、基本医疗、计划生育指导等服务。